Перенаселение здесь точно не причина, рыбки все мелкие, подмены частые - так что это точно не то. Как вариант в воде поселился какой то "паразит" который предпочитает гуппи ( судя по симптомам - худеют, нарушается ориентация). На поверхности рыб не было пятен либо других изменений? Но травить химией весь аквариум только по догадкам, я бы не стала, все же массовой гибели нет - может вам по заимствовать у кого нибудь стерилизатор и попробовать включить его на несколько дней, таким образом очистить воду от бактерий и простейших. А какой водой подмены делаете?